Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx4Q91YJ2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms