Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf183Q8QZS5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf183Q8QZS5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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