Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt33aQ8K0Y2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33aQ8K0Y2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms