Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l1Q8C0J2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg16l1Q8C0J2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms