Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35Q6ZWV7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rpl35Q6ZWV7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rpl35Q6ZWV7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rpl35Q6ZWV7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rpl35Q6ZWV7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rpl35Q6ZWV7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rpl35Q6ZWV7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rpl35Q6ZWV7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rpl35Q6ZWV7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rpl35Q6ZWV7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms