Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms