Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vamp1Q62442 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vamp1Q62442 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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