Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zpr1Q62384 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms