Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sox19Q62249 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox19Q62249 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox19Q62249 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox19Q62249 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sox19Q62249 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sox19Q62249 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sox19Q62249 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sox19Q62249 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sox19Q62249 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sox19Q62249 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sox19Q62249 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sox19Q62249 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox19Q62249 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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