Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bod1Q5SQY2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bod1Q5SQY2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms