Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms