Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms