Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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RAB40BQ12829 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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RAB40BQ12829 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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RAB40BQ12829 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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RAB40BQ12829 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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RAB40BQ12829 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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RAB40BQ12829 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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