Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Spata18Q0P557 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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Spata18Q0P557 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Spata18Q0P557 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Spata18Q0P557 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Spata18Q0P557 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Spata18Q0P557 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Spata18Q0P557 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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