Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms