Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms