Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfdP97946 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfdP97946 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms