Protein–RNA interactions for Protein: P97861

Krt86, Keratin, type II cuticular Hb6, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt86P97861 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt86P97861 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt86P97861 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt86P97861 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms