Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8a1P70704 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8a1P70704 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms