Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdh10P70408 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdh10P70408 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdh10P70408 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdh10P70408 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdh10P70408 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdh10P70408 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdh10P70408 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdh10P70408 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdh10P70408 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdh10P70408 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdh10P70408 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdh10P70408 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cdh10P70408 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh10P70408 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms