Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms