Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl5P47962 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms