Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tac1P41539 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tac1P41539 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms