Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik2P39087 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms