Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rfc1P35601 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms