Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfap2aP34056 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms