Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms