Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa1P11477 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa1P11477 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms