Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fv4P11370 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fv4P11370 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fv4P11370 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fv4P11370 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms