Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P10404 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P10404 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P10404 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P10404 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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