Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChkbO55229 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChkbO55229 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChkbO55229 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms