Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna4O35343 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms