Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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BC117090L7N257 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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BC117090L7N257 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC117090L7N257 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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BC117090L7N257 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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BC117090L7N257 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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BC117090L7N257 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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BC117090L7N257 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC117090L7N257 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC117090L7N257 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC117090L7N257 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC117090L7N257 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC117090L7N257 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BC117090L7N257 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BC117090L7N257 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BC117090L7N257 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BC117090L7N257 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BC117090L7N257 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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