Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm8356J3QPD3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm8356J3QPD3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm8356J3QPD3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm8356J3QPD3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm8356J3QPD3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm8356J3QPD3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm8356J3QPD3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm8356J3QPD3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm8356J3QPD3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm8356J3QPD3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm8356J3QPD3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8356J3QPD3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8356J3QPD3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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