Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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