Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms