Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc170D3YXL0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms