Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms