Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Upf2A2AT37 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms