Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms