Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 YWHABP1-201ENST00000445359 727 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 443.4 ms