Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FAM187BQ17R55 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms