Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 CACNA1D-203ENST00000422281 6414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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PTPRMP28827 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPRMP28827 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
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