Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms