Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 OR52A1-201ENST00000328942 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AL353653.1-202ENST00000435177 539 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 CC2D2A-207ENST00000507954 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LALBA-202ENST00000549817 1243 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms