Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 VDAC1P8-210ENST00000610068 1251 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 FAM184A-213ENST00000617072 1251 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CFAP61-210ENST00000451767 1946 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SLC25A51-201ENST00000242275 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OR14I1-201ENST00000342623 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL731537.1-201ENST00000343087 421 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RNA5SP161-201ENST00000363871 115 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TRBV6-1-201ENST00000390353 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC131097.2-201ENST00000404031 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC008770.1-201ENST00000406892 1257 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LINC00159-202ENST00000414877 428 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NIF3L1-206ENST00000416651 967 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CCNT2-AS1-203ENST00000428857 677 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LINC00869-202ENST00000430442 1065 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RPL35P8-201ENST00000433284 337 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC006159.1-201ENST00000452009 386 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 UBE2R2-AS1-201ENST00000454429 647 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RN7SL201P-201ENST00000482306 296 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL355076.1-201ENST00000484315 270 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RN7SL862P-201ENST00000491550 298 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RN7SL792P-201ENST00000496286 305 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RPL7AP2-201ENST00000496515 740 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LINC01096-201ENST00000501050 1263 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC109811.2-201ENST00000509609 452 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 GCSHP1-201ENST00000512554 484 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC090568.2-203ENST00000521433 579 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC091820.2-201ENST00000521697 523 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 C11orf65-203ENST00000525729 1263 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL133304.3-201ENST00000550089 477 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL354733.2-205ENST00000590813 621 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ZNF98-205ENST00000601553 566 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL109933.4-201ENST00000612111 157 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.30-201ENST00000621054 280 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SULT1C2-202ENST00000326853 2828 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms