Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM71Q2Q1W2 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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