Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abt1Q9QYL7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abt1Q9QYL7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms