Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG9

Tinf2, TERF1-interacting nuclear factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tinf2Q9QXG9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tinf2Q9QXG9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tinf2Q9QXG9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms