Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hip1rQ9JKY5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hip1rQ9JKY5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms